Caro zezinho1320, boa tarde.
Há vários elementos a considerar na situação que descreve, de entre os quais podemos destacar a mobilidade funcional, a mudança de categoria, a alteração às condições contratuais, a alegada discriminação por doença, entre outros.
Não existe regulamentação que permita estabelecer de forma inequívoca que a "doença crónica" não deve ser motivo de discriminação, pelo que lhe deixamos a forte sugestão de que consulte um advogado que possa contextualizar legalmente a situação e aconselhá-lo quanto ao que fazer para atingir os seus objetivos.