Caro João Paulo Almeida, boa tarde.
A resposta é negativa, o trabalhador não pode exigir que o subsídio de refeição seja pago em dinheiro. Por princípio, qualquer alteração àquilo que inicialmente foi acordado/contratado com o trabalhador, a título individual (contrato de trabalho individual), deve ser negociado e acordado (novamente) com o trabalhador. No entanto, aqui não se trata de uma alteração estrutural, mantém-se o benefício de receber o subsídio de refeição, apenas é alterada a forma como este é pago.