Sim, em Portugal, mesmo estando de baixa médica, pode casar-se. A baixa médica justifica a sua ausência no trabalho devido a uma condição de saúde, mas não impede que participe em eventos pessoais importantes como o seu casamento
sabiasque.pt/forum/11-atestados-baixas-m...censa-casamento.html
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No entanto, é importante comunicar ao seu empregador sobre a data do casamento e assegurar que todos os procedimentos estejam em conformidade com as normas legais. Se tiver direito a licença de casamento, que são dias de ausência justificada, poderá gozá-los após o término da baixa médica.
Desejo-lhe um dia maravilhoso e muitas felicidades no seu casamento!