O Hospital de Faro caracterizar-se como hospital central de referência no SNS e na região, com funções diferenciadas na prestação de cuidados de saúde, na formação pré e pós-graduada e contínua, sustentadas na permanente atualização do conhecimento científico e técnico dos seus profissionais.
Caracterizar-se como garante na segurança em saúde de todos os que habitam ou visitam a região do Algarve e a sua área de influência.