Caro AlphaPT, boa tarde.
Parece-nos que possa haver algum tipo de equívoco, uma vez que não é legal alterar um documento, qualquer ele que seja, sem a autorização ou, pelo menos, o conhecimento do seu autor.
Relativamente à 2ª questão, está perante uma ilegalidade, uma vez que os contratos de trabalho são para cumprir, de parte a parte, e no que diz respeito a horário, todo o serviço que seja prestado para além das horas contratadas deve ser considerado trabalho suplementar e pago como tal.