Caro bas roc, boa tarde.
As circunstâncias que descreve são "normais", sendo que o empregador não lhe poderá "arranjar problemas". O trabalhador tem direito a faltar por motivos de doença. O que vai acontecer é que os dias de falta serão descontados do valor que tem a receber por caducidade de contrato.
Quanto à questão da junta médica, a verdade é que o empregador pode pedir uma avaliação, sim, mas estamos em crer que o custo e tempo gastos em fazê-lo serão motivos suficientes para que o empregador não o faça para uma baixa de (apenas) 8 dias.
Quanto aos "problemas terei com ele sem ser os de saude", não temos como avaliar, pois não conhecemos a situação em pormenor. Tratando-se de uma situação "normal", em que o contrato a termo não é renovado, é declarada caducidade de contrato para efeitos de requerer o subsídio de desemprego (no formulário que pede ao empregador para apresentar à Seg. Social). Tendo recebido a comunicação de não renovação de contrato, tem a receber os valores que encontra descritos em sabiasque.pt/trabalho/legislacao/565-caducidade-de-contrato-de-trabalho-a-termo-certo.html